Η παρακάτω ανακοίνωση απευθύνεται κυρίως σε φοιτητές 7ου και παραπάνω εξαμήνων, που σκοπεύουν να παρακολουθήσουν (ή έχουν παρακολουθήσει) το μάθημα Εξόρυξη Γνώσης και Συστήματα Λήψης Αποφάσεων (Ε705).
Η ομάδα iGEM Thessaly 2026 (με τέσσερα μέλη από το Τμήμα Ψηφιακών Συστημάτων), σας καλεί να δείτε και να δοκιμάσετε το Noctua, το λογισμικό που ανέπτυξε για τον σχεδιασμό πρωτεϊνών με χρήση state-of-the-art machine learning models. Το Noctua είναι μια web εφαρμογή με την οποία ο χρήστης δημιουργεί μια ροή εργασίας μέσω της οποίας:
- παράγει υποψήφιες πρωτεΐνες,
- ελέγχει πόσο καλά δένονται στον στόχο, και τέλος,
- φιλτράρει τις υποψήφιες πρωτεΐνες ώστε να μείνουν μόνο οι καλύτερες
Τα παραπάνω βήματα ακολουθούνται για να σχεδιαστεί μια πρωτεΐνη που θα “κουμπώνει” πάνω σε ένα στόχο, όπως για παράδειγμα πάνω σε ένα καρκινικό κύτταρο. Το πρόβλημα είναι εξαιρετικά πολύπλοκο υπολογιστικά για να λυθεί με συμβατικές μεθόδους. Ο χρήστης επιλέγει υπολογιστικά μοντέλα, φίλτρα, κτλ., και δημιουργεί μια ροή εργασίας χωρίς να γράψει καθόλου κώδικα. Μέσω της εφαρμογής ο σχεδιασμός πρωτεϊνών γίνεται πιο εύκολος τόσο για όσους γνωρίζουν από τεχνητή νοημοσύνη και μηχανική μάθηση αλλά όχι από βιολογία, όσο και τους βιολόγους/βιοτεχνολόγους/βιοχημικούς που δεν γνωρίζουν προγραμματισμό.
Οι ροές που δημιουργούνται “τρέχουν” στον machine learnign server του Τμήματος (AMD EPYC 9254 (24 cores / 48 threads), 2 X nVidia RTX 6000 Ada (2X48GB GDDR6), 128 GB DDR5 RAM).
Δεν απαιτούνται γνώσεις βιολογίας ή προγραμματισμού. Παρόλα αυτά είναι μια καλή ευκαιρία για όσους ενδιαφέρονται για εφαρμογές ΤΝ να δουν κάτι που θεωρείται state-of-the-art και τομέας με έντονο ενδιαφέρον για απορρόφηση αποφοίτων ΙΤ με γνώσεις Μηχανικής Μάθησης (βλ. μάθημα Ε705).
- Πότε: Δευτέρα 28-09-2026 @11:00 (διάρκεια μία ώρα)
- Που: Εργαστήριο 3 ή 4 (Κτίριο Εργαστηρίων ΤΨΣ)
Φόρμα για συμμετοχή: https://forms.gle/wcjhWRPkH8AdMPSU6
